Next Generation Sequencing solutions

VIASURE Bacterial & Fungal NGS Solution

VS-NBF0148PHRUO / VS-NBF0148PLRUO

Identificación y perfilado simultáneos de ADN de bacterias y hongos a través de dominios variables de los genes 16S rRNA e ITS, respectivamente.

Formato

VIASURE Bacterial & Fungal NGS Solution es una solución integral para la preparación de librerías NGS y el análisis bioinformático posterior. Está diseñada específicamente para la caracterización de comunidades bacterianas y fúngicas a partir de ADN extraído de cualquier tipo de muestra. La solución se basa en la amplificación de tres regiones variables (V1–V3) del gen del ARN ribosómico 16S bacteriano y la región ITS2 del gen ITS del ARN ribosómico fúngico.

El ADN extraído se somete de forma simultánea a un enriquecimiento dirigido y a la indexación mediante PCR, utilizando códigos de barras únicos y adaptadores de secuenciación necesarios para el análisis posterior. El kit permite la multiplexación de hasta 48 muestras en una sola corrida de secuenciación. Para obtener resultados óptimos, se recomienda que cada librería alcance aproximadamente 150.000 lecturas paired-end. La secuenciación debe realizarse en configuración paired-end 2×300 bp.

Características

Método de enriquecimiento: Amplicon-based enrichment
Plataformas: Illumina (MiSeq) and Element Biosciences-AVITI
Tamaño de librería: 500–600 bp
Requisitos de entrada de ADN: 5 µL de su muestra. No necesita preocuparse por la entrada
Nº de pools por panel: 1
Tipos de muestra admitidos: Muestras biológicas o cultivo
Análisis secuenciación: Software V-Xplora
Plexity: Hasta 48
Tiempo de trabajo: <30 min
Research use only

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